Påven avreser från Ciampino-flygfältet i Rom torsdagen den 18 augusti kl. 10.00 med beräknad ankomst till den internationella flygplatsen Köln/Bonn klockan 12.00. Efter välkomstceremonin kommer han att i bil bege sig till Kölns ärkebiskopssäte. Efter lunchen beger han sig till Rodenkirchenbrücke och färdas med båt på Rhen fram till Poller Rheinwiesen, en äng belägen vid Rhens strand. Där kommer välkomstfesten för ungdomarna att äga rum. Efter ceremonins slut återvänder den Helige Fadern med båt och besöker sedan Kölns katedral.
Fredagen den 19 augusti firar han den heliga Mässan privat i Kölns ärkebiskopspalats. Därefter beger han sig i bil till Villa Hammerschmidt i Bonn, där han kl. 10.30 avlägger artighetsvisit hos Förbundsrepubliken Tysklands president, Horst Köhler. En timme senare besöker han Kölns synagoga. Klockan 13.00 återvänder han till ärkebiskopssätet för att äta lunch med en grupp ungdomar. Klockan 17.00 träffar han seminarister i St. Pantaleon-kyrkan i Köln och återvänder sedan till ärkebiskopspalatset för att delta i en ekumenisk träff.
Lördagen den 20 augusti firar han en privat mässa i ärkebiskopspalatset och tar sedan emot olika tyska politiker och civila personligheter i audiens, t.ex. kansler Gerhard Schroeder, parlamentets president Wolfgang Thierse, CDU:s partiordförande Angela Merkel, Nordrhein-Westfalens ministerpresident Jürgen Rüttgers och några lokala myndighetspersoner. Klockan 18.00 träffar han representanter för några muslimska församlingar. Sedan beger han sig i bil till Mariafältet (Marienfeld, ett tidigare dagbrott för brunkol) där vigilian/vakan för ungdomarna äger rum fram till klockan 23.00.
Söndagen den 21 augusti klockan 10.00 kommer Benedikt XVI att på Mariafältet fira den heliga Mässan och därefter be Angelus-bönen. Efter lunch i ärkebiskopspalatset kommer han att bege sig till fots till Kölnseminariets Pius-sal och träffar där biskoparna som deltar i den tyska biskopskonferensen. Efter att ha hälsat på medlemmarna i organisationskommittén för Världsungdomsdagen 2005 åker han i bil till Köln/Bonns internationella flygplats. Klockan 18.45 äger avskedsceremonin rum. Därefter anträder påven hemresan till Rom, dit han beräknas ankomma runt 21.15.