Antoni Pujals studerade juridik vid Universitetet i Barcelona. Därefter studerade han teologi i Rom.

Från 1980 till 2002 arbetade han på Opus Deis prelatsämbete i Rom, vid biskop Alvaro del Portillo och senare även biskop Javier Echevarría.

Han erhöll sin doktorsexamen i kanonisk rätt vid det heliga Korsets påvliga universitet i Rom, med en avhandling med titeln ”Det Juridiska Förhållandet vid inkardinationen enligt kyrkolagen 1983".

Från 2002 till 2016 var han vikarie i Opus Dei för Katalonien.

I januari 2017 utnämndes han som Centralsekreterarvikarien av msgr. Fernando Ocáriz, Opus Deis Prelat.

Den 14 maj 2019 blev f. Pujals utnämnd till generalvikarie.