Antoni Pujals licenciou-se em Direito na Universidade de Barcelona. Posteriormente, mudou-se para Roma para completar estudos de Teologia.

De 1980 a 2002, trabalhou na sede central do Opus Dei, junto de Mons. Álvaro del Portillo e Mons. Javier Echevarría.

Concluiu o doutoramento em Direito Canónico na Universidade Pontifícia da Santa Cruz com um trabalho intitulado “A relação jurídica de incardinação segundo o Código de 1983”.

De 2002 a 2016, foi vigário do Opus Dei na Catalunha.

Em janeiro de 2017, foi nomeado Vigário secretário central por Mons. Fernando Ocáriz, Prelado do Opus Dei. Desde maio de 2019 até abril de 2025 foi o Vigário geral.