Епископ Хавьер Эчеваррия - доктор гражданского и канонического права и принадлежит к Оpus Dei с 1948 года. Он принял сан священника 7 августа 1955 года и тесно сотрудничал с отцом Хосемарией Эскривой, секретарем которого он работал с 1953 года, включительно до его кончины в 1975 году. Он член Генерального Совета Оpus Dei с 1966 года.
В 1975 году, когда Альваро дель Портильо стал преемником св. Хосемарии Эскривы, он был назначен генеральным секретарем Оpus Dei, должность которой до тех пор занимался Альваро дель Портильо. В 1982 году, когда Оpus Dei был провозглашен персональной Прелатурой, он стал генеральным викарием Прелатуры.
С 1981 года он является консультантом Конгрегации канонизации святых, и с 1995 года – Конгрегации по делам духовенства.
После его избрания Съездом и назначения Иоанном Павлом II прелатом Оpus Dei 20 апреля 1994 года, Папа Римский рукоположил его в епископы 6 января 1995 года в Соборе святого Петра.
Он почил во Христе12 декабря 2016 г., в праздник Гваделупской Божьей Матери.