Após uma curta atividade na indústria privada, trabalhou como colaborador científico no Instituto de Termodinâmica da ETH e registou diversas patentes. Alguns anos depois, sensível à pobreza dos países em vias de desenvolvimento, mudou as suas ocupações para criar, juntamente com outras pessoas, a Fundação Limmat, com sede em Zurique.
Sob a sua direção, esta instituição promoveu, nos 17 anos seguintes, centenas de projetos de interesse público em mais de trinta países de quatro continentes, centrados sobre tudo na promoção da família e da mulher, no atendimento médico e na formação profissional da juventude.
Em 1962 Toni Zweifel pediu a admissão no Opus Dei, uma instituição da Igreja Católica – hoje Prelatura pessoal – que por inspiração divina S. Josemaria fundou com o fim de promover a chamada de todos os cristãos à santidade no desempenho dos seus deveres profissionais e familiares.
Toni seguiu esta vocação com entrega total e absoluta fidelidade até ao final da sua vida. O seu trabalho caracterizou-se por uma grande qualidade humana e sobrenatural, levado pelo seu desejo de ajudar o próximo com eficácia. Tudo isso unido a um cordial sentido de humor e a um estilo de vida cheio de simplicidade.
Toni aceitou, com entrega plena à vontade de Deus, a doença incurável que o atingiu em 1986, quando se encontrava no auge da sua atividade. Morreu de leucemia em Zurique, em 24 de novembro de 1989, com fama de santidade.