José Javier Marcos è nato a Palencia, in Spagna, il 19 marzo 1961. Ha studiato Giurisprudenza nelle Università di Valladolid e Leόn. È dottore in Teologia nell’Università Pontificia della Santa Croce.

Dal 1984 al 1990 ha esercitato la libera professione di avvocato a Burgos, in Spagna, dove è stato Presidente dell’Associazione dei giovani avvocati e, oltre ad aver partecipato a vari congressi e riunioni su questioni giuridiche, ha fatto parte, come consigliere, di una commissione speciale sulle problematiche della tossicodipendenza e dell’aiuto al tossicomane (1987-1990).

Nel 1992 è stato nominato Direttore della promozione e sviluppo e membro del Consiglio del Rettore dell’Università della Santa Croce, coordinando e dirigendo le aree di promozione economica, ufficio informazione, consulenza giuridica, pubblicazioni e dipartimento del personale.

Dopo la sua ordinazione sacerdotale, avvenuta nel 1998, ha insegnato Teologia morale. È autore di diverse pubblicazioni su affettività e vita morale cristiana.

Nel 2010 è stato nominato Vicario segretario centrale della Prelatura dell’Opus Dei.