Dans le cas de plaintes sérieuses et raisonnables de nature institutionnelle, afin de favoriser les processus de réparation, la prélature dispose d'un protocole d'action qui prévoit actuellement ce qui suit :
1) Le traitement de ces plaintes est effectué dans le pays auquel les faits se réfèrent.
2) Là où cela a été jugé opportun, le vicaire régional a créé un bureau de médiation et de conciliation.
3) La plainte doit être adressée au vicaire régional de la circonscription concernée en contactant le coordinateur à l'adresse électronique suivante : ecoute.cm@opusdei.org.