En muchas ocasiones, da validez a los evangelios gnósticos, invenciones literarias basadas en la vida de Cristo, escritas a partir del siglo II. Los evangelios que la Iglesia considera verdaderos fueron escritos en el siglo I y ya en el año 150 se los consideraba rigurosos, frente a las demás creaciones. El Evangelio de María Magdalena , citado en el libro, fue escrito por autores de una secta gnóstica, es decir, que no pertenecían a la Iglesia Católica.
En la novela de Dan Brown hay rasgos de obras esotéricas, pseudohistóricas o new age. Muchas afirmaciones de El Código da Vinci se publicaron anteriormente en libros que ningún historiador valora, como Los 16 salvadores del mundo crucificados , escrito por Kersey Graves en 1875; o Holy Blood, Holy Grail (en castellano El enigma sagrado ) de Henry Lincoln, Michael Baigent y Richard Leigh, publicado en 1982.